Penataan Kelembagaan Kementerian Desa, PDT, dan Transmigrasi untuk tahun 2020-2024, hingga saat ini masih terus dilakukan penyempurnaan. Kegiatan rapat terus diagendakan guna menyempurnakan Struktur Organsasi Kementerian yang baru. Adapun rapat terbaru yang diselengarakan oleh Bagian Organisasi dan Tata Laksana, Biro Hukum & Ortala, Sekretariat Jenderal, Kementerian Desa, PDT, dan Transmigrasi, bertempat di ruang eksekutif lantai 2 gedung utama Kementerian Desa, PDT, dan Transmigrasi pada hari Jumat, 5 Juni 2020.
Rapat dihadiri oleh Tim Unit Manajemen Strategis, Biro Umum & SDM yang diwakili oleh Bagian Kepegawaian, dan Biro Hukum & Ortala selaku penyelenggara. Rapat juga disiarkan secara live melalui aplikasi Zoom, sehingga partisipan yang tidak dapat hadir ke ruang rapat eksekutif dikarenakan protokol penanganan COVID-19 yang mengharuskan peserta rapat hanya 15 -20 orang dalam ruangan, dapat mengikut jalannya rapat dan mengetahui perkembangan penataan kelembagaan kementerian yang baru. Adapun rapat masih terkait dengan isu pengalihan jabatan structural ke fungsional.
Hingga saat ini, masih belum terdapat keputusan secara nasional terkait unit eselon III ke bawah akan ditiadakan atau masih dipertahankan. Sebagaimana arahan presiden yang menyebutkan bahwa eselon III dan eselon IV kemungkinan akan dipangkas, hal tersebut dilakukan guna meringkas birokrasi, sehingga organisasi menjadi lebih lincah dan lebih luwes dalam memberikan layanan dan kinerja yang efektif serta efisien.